神秘的EVA零号机驾驶员绫波丽，在与碇元度约定之时，来到了NERV底层中央教条的红色水池边。她的命运似乎就将在此结束。 在危急时刻，葛城美里不但要完成加持良治交待的对“第二次浩劫”真相以及“人类补完计划”的探查工作，还要保护碇真嗣与明日香，以及防备SEELE 对初号机与二号机的物理接触。 出于对碇元度的憎恨，赤木律子接受了SEELE引爆MAGI的提案，她能否成功？长期与SEELE共事的碇元度、冬月耕造、碇唯，为了防止人类“最终的悲剧”，而酝酿了的“人类补完计划”能否实现？尽在《新世纪福音战士》电影版第2部中解答。
演员：村瀬步 古川慎 大桥贤一郎 诹访部顺一 小西克幸 津田健次郎 小林优 樱井孝宏 绪方贤一 佐藤拓也 日笠阳子 中井和哉 内山昂辉 茅野爱衣 岛崎信长 冈本信彦 小野大辅 山路和弘
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演员：铃代纱弓 幸村惠理 仲谷明香 濑户麻沙美 山村响 富田美忧 矢岛晶子 藤原启治 吉冈美咲 冈咲美保 岛袋美由利 古贺葵 川井田夏海 大久保瑠美 上田耀司 东山奈央 清水彩香 西村知道 田中完 山本和臣 关根明良 松田利冴 松田飒水 伊藤静 渊上舞 斧笃 山本格 松本忍 长谷川芳明 佐佐木义人 手冢弘道 小伏伸之 樱井敏治 荒井聪太 小市真琴 前田佳织里 土田大 真殿光昭 宫下早纪 小西克幸 中博史
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